Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nlrp4cQ3TKR3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Nlrp4cQ3TKR3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms