Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl2bQ3TD49 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl2bQ3TD49 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sppl2bQ3TD49 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sppl2bQ3TD49 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sppl2bQ3TD49 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sppl2bQ3TD49 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sppl2bQ3TD49 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms