Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ccdc162pQ0VG85 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccdc162pQ0VG85 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ccdc162pQ0VG85 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ccdc162pQ0VG85 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms