Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V9

Slc45a4, Solute carrier family 45 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc45a4Q0P5V9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc45a4Q0P5V9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc45a4Q0P5V9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc45a4Q0P5V9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc45a4Q0P5V9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms