Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NeblQ0II04 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NeblQ0II04 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NeblQ0II04 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NeblQ0II04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NeblQ0II04 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms