Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nfe2Q07279 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nfe2Q07279 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nfe2Q07279 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Nfe2Q07279 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nfe2Q07279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms