Protein–RNA interactions for Protein: Q03265

Atp5a1, ATP synthase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5a1Q03265 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5a1Q03265 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Atp5a1Q03265 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp5a1Q03265 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms