Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sec23aQ01405 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sec23aQ01405 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sec23aQ01405 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Sec23aQ01405 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Sec23aQ01405 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms