Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HmgcrQ01237 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HmgcrQ01237 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HmgcrQ01237 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HmgcrQ01237 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HmgcrQ01237 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms