Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Shc1P98083 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shc1P98083 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Shc1P98083 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Shc1P98083 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc1P98083 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shc1P98083 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc1P98083 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shc1P98083 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms