Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pitx2P97474 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pitx2P97474 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pitx2P97474 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pitx2P97474 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pitx2P97474 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms