Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sec1P97353 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sec1P97353 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sec1P97353 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec1P97353 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sec1P97353 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec1P97353 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sec1P97353 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec1P97353 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sec1P97353 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sec1P97353 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms