Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SeboxP70368 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SeboxP70368 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SeboxP70368 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms