Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Frat1P70339 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frat1P70339 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frat1P70339 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Frat1P70339 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Frat1P70339 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Frat1P70339 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat1P70339 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat1P70339 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat1P70339 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Frat1P70339 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Frat1P70339 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Frat1P70339 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Frat1P70339 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms