Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acta1P68134 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Acta1P68134 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acta1P68134 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Acta1P68134 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Acta1P68134 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms