Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Barhl1P63157 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Barhl1P63157 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Barhl1P63157 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Barhl1P63157 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms