Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vamp3P63024 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp3P63024 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vamp3P63024 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp3P63024 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms