Protein–RNA interactions for Protein: P62876

Polr2l, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2lP62876 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Polr2lP62876 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Polr2lP62876 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr2lP62876 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr2lP62876 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms