Protein–RNA interactions for Protein: P62852

Rps25, 40S ribosomal protein S25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps25P62852 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps25P62852 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps25P62852 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rps25P62852 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rps25P62852 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rps25P62852 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rps25P62852 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rps25P62852 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms