Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rpl23P62830 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rpl23P62830 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rpl23P62830 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms