Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SnrpeP62305 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SnrpeP62305 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SnrpeP62305 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SnrpeP62305 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms