Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmo4P61969 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmo4P61969 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Lmo4P61969 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Lmo4P61969 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms