Protein–RNA interactions for Protein: P61967

Ap1s1, AP-1 complex subunit sigma-1A, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s1P61967 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ap1s1P61967 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ap1s1P61967 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ap1s1P61967 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ap1s1P61967 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms