Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Stx1bP61264 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stx1bP61264 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Stx1bP61264 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Stx1bP61264 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms