Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps5P59438 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hps5P59438 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps5P59438 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hps5P59438 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps5P59438 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Hps5P59438 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hps5P59438 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps5P59438 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps5P59438 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hps5P59438 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hps5P59438 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hps5P59438 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms