Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Snrpa1P57784 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Snrpa1P57784 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Snrpa1P57784 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Snrpa1P57784 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Snrpa1P57784 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Snrpa1P57784 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms