Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Usp25P57080 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp25P57080 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp25P57080 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp25P57080 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp25P57080 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp25P57080 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp25P57080 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp25P57080 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp25P57080 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp25P57080 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp25P57080 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp25P57080 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp25P57080 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms