Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lim2P56563 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lim2P56563 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lim2P56563 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lim2P56563 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lim2P56563 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lim2P56563 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lim2P56563 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lim2P56563 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lim2P56563 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms