Protein–RNA interactions for Protein: P55144

Tyro3, Tyrosine-protein kinase receptor TYRO3, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyro3P55144 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tyro3P55144 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tyro3P55144 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tyro3P55144 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tyro3P55144 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tyro3P55144 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms