Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nub1P54729 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nub1P54729 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nub1P54729 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nub1P54729 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nub1P54729 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nub1P54729 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms