Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PctpP53808 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PctpP53808 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PctpP53808 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PctpP53808 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PctpP53808 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PctpP53808 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PctpP53808 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PctpP53808 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PctpP53808 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PctpP53808 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PctpP53808 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PctpP53808 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PctpP53808 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PctpP53808 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PctpP53808 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PctpP53808 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PctpP53808 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PctpP53808 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PctpP53808 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PctpP53808 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PctpP53808 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PctpP53808 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PctpP53808 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PctpP53808 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PctpP53808 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PctpP53808 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PctpP53808 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PctpP53808 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
PctpP53808 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PctpP53808 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PctpP53808 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PctpP53808 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PctpP53808 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PctpP53808 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PctpP53808 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PctpP53808 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PctpP53808 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PctpP53808 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PctpP53808 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PctpP53808 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PctpP53808 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PctpP53808 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PctpP53808 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PctpP53808 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PctpP53808 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PctpP53808 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PctpP53808 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PctpP53808 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PctpP53808 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PctpP53808 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PctpP53808 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PctpP53808 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PctpP53808 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PctpP53808 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PctpP53808 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PctpP53808 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PctpP53808 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PctpP53808 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PctpP53808 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PctpP53808 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PctpP53808 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PctpP53808 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PctpP53808 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PctpP53808 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PctpP53808 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PctpP53808 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PctpP53808 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PctpP53808 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PctpP53808 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PctpP53808 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PctpP53808 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PctpP53808 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PctpP53808 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.7 ms