Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Efnb1P52795 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Efnb1P52795 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Efnb1P52795 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Efnb1P52795 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms