Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rpl5P47962 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl5P47962 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl5P47962 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rpl5P47962 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl5P47962 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl5P47962 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl5P47962 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl5P47962 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rpl5P47962 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rpl5P47962 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rpl5P47962 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rpl5P47962 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpl5P47962 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpl5P47962 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms