Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SrprbP47758 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SrprbP47758 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SrprbP47758 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SrprbP47758 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SrprbP47758 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SrprbP47758 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms