Protein–RNA interactions for Protein: P41778

Pbx1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx1P41778 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pbx1P41778 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx1P41778 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx1P41778 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pbx1P41778 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx1P41778 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms