Protein–RNA interactions for Protein: P35951

Ldlr, Low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdlrP35951 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LdlrP35951 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LdlrP35951 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LdlrP35951 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdlrP35951 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LdlrP35951 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LdlrP35951 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LdlrP35951 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdlrP35951 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LdlrP35951 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms