Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ddit3P35639 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ddit3P35639 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ddit3P35639 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ddit3P35639 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms