Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mmp13P33435 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Mmp13P33435 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mmp13P33435 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mmp13P33435 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms