Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msr1P30204 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msr1P30204 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Msr1P30204 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msr1P30204 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Msr1P30204 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msr1P30204 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msr1P30204 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Msr1P30204 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Msr1P30204 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Msr1P30204 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms