Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa5P28312 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Defa5P28312 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Defa5P28312 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Defa5P28312 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Defa5P28312 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Defa5P28312 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms