Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gadd45bP22339 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Gadd45bP22339 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gadd45bP22339 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gadd45bP22339 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gadd45bP22339 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gadd45bP22339 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms