Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd44P15379 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd44P15379 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd44P15379 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd44P15379 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cd44P15379 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd44P15379 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cd44P15379 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cd44P15379 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd44P15379 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd44P15379 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Cd44P15379 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cd44P15379 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms