Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RapsnP12672 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RapsnP12672 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RapsnP12672 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RapsnP12672 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RapsnP12672 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RapsnP12672 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RapsnP12672 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RapsnP12672 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RapsnP12672 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RapsnP12672 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RapsnP12672 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms