Protein–RNA interactions for Protein: P09240

Cck, Cholecystokinin, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckP09240 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckP09240 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckP09240 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CckP09240 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CckP09240 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CckP09240 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckP09240 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckP09240 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CckP09240 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CckP09240 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CckP09240 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CckP09240 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CckP09240 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CckP09240 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CckP09240 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckP09240 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckP09240 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CckP09240 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckP09240 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckP09240 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CckP09240 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CckP09240 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CckP09240 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CckP09240 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CckP09240 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms