Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Prm2P07978 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prm2P07978 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Prm2P07978 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Prm2P07978 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Prm2P07978 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Prm2P07978 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms