Protein–RNA interactions for Protein: P06327

Gm5629, Ig heavy chain V region VH558 A1/A4, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5629P06327 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm5629P06327 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5629P06327 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm5629P06327 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5629P06327 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5629P06327 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5629P06327 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm5629P06327 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm5629P06327 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms