Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Krt1P04104 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt1P04104 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt1P04104 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt1P04104 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt1P04104 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt1P04104 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt1P04104 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt1P04104 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Krt1P04104 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Krt1P04104 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt1P04104 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt1P04104 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt1P04104 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt1P04104 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt1P04104 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt1P04104 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt1P04104 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms