Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
P01822 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01822 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01822 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01822 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01822 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P01822 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01822 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01822 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01822 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01822 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01822 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01822 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01822 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01822 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01822 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01822 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01822 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01822 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01822 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01822 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
P01822 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
P01822 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01822 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01822 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01822 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01822 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
P01822 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01822 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
P01822 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01822 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01822 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01822 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01822 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01822 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01822 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
P01822 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01822 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01822 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01822 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
P01822 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms