Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01746 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01746 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01746 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01746 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01746 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01746 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01746 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P01746 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01746 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01746 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01746 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01746 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01746 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01746 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01746 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01746 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01746 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01746 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01746 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01746 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01746 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01746 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01746 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01746 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01746 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01746 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01746 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01746 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01746 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01746 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01746 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
P01746 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01746 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01746 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01746 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01746 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01746 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01746 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01746 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01746 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01746 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01746 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01746 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01746 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01746 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01746 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01746 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01746 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01746 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01746 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01746 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01746 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01746 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01746 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01746 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01746 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
P01746 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01746 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01746 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01746 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01746 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01746 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01746 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms