Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
P01650 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01650 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01650 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01650 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
P01650 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
P01650 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01650 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01650 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
P01650 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
P01650 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01650 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
P01650 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
P01650 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
P01650 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
P01650 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
P01650 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
P01650 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
P01650 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
P01650 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
P01650 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01650 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
P01650 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
P01650 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
P01650 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01650 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
P01650 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
P01650 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01650 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01650 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01650 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01650 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
P01650 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01650 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01650 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01650 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01650 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
P01650 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
P01650 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01650 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
P01650 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01650 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
P01650 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
P01650 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms